由朱丽兰部长签发的科技部第4号令（《国家科技计划管理暂行规定》）和科技部第5号令（《国家科技计划项目管理暂行办法》）已正式下发。
《国家科技计划管理暂行规定》主要以国家科技计划的设立、各类国家科技计划管理办法的制定程序、国家科技计划管理的责任机制、国家科技计划的管理制度等章节对国家级科技计划的管理进行规范。《国家科技计划项目管理暂行办法》主要从项目立项、项目实施管理、项目验收、专家咨询等环节对国家级科技计划项目的管理进行规范。
《规定》和《办法》都特别强调依法行政的概念，力求“十五”国家科技计划管理的法制化。《规定》和《办法》中不但规范和约束被管理者的行为，而更多、更重要的是增加了规范管理者自身行为的有关条款，体现了政府职能转变和科技计划管理的新观念、新方式。
《规定》和《方法》不仅规定了责任各方的权利和义务，也规定了执行程序方面的责任。也就是说，不但规定计划具体内容，更强调规定程序的责任以及违反程序应负的行政责任，有利于从源头上克服腐败，保证公正。此外，《规定》和《方法》还提出了管理公开制度、报告制度、咨询制度等一系列的管理制度，这样既有利于社会和公众对国家科技计划的了解和参与，也符合国际上各国政府科技计划管理的惯例。
